Tarmflora, eller tarmens mikrobiota, är samlingsnamnet för alla mikroorganismer som finns i tarmarna. Hos spädbarn måste tarmfloran först etablera sig och utvecklas. Olika studier pekar på att tillväxten/koloniseringen av tarmfloran startar redan i livmodern och man vet att tarmfloran förändras över tiden. Eftersom en hälsosam tarmflora är avgörande för en bra hälsa och ett bra immunförsvar, är en god tarmflora innehållande till exempel bifidobakterier och laktobaciller viktigt. Dessa goda bakterier kan motverka tillväxten av andra, sjukdomsalstrande bakterier. Tarmfloran stödjer också utvecklingen av immunsystemet som fortfarande är omoget vid födseln. Tarmfloran påverkas av förlossningssätt, eventuella mediciner (ex Antibiotika), maten man äter och även av omgivningen.